Le N,O-Bis(triméthylsilyl)trifluoroacétamide (BSTFA) (CAS : 25561-30-2) est utilisé pour la synthèse d'intermédiaires pharmaceutiques. Utilisé comme réactif dans la préparation de ribosides de pyrimidinone et d'analogues qui présentent des propriétés antitumorales. Le BSTFA avec le triméthylchlorosilane a trouvé une application en chromatographie en phase gazeuse (GC) et en spectrométrie de masse (MS). Le BSTFA est similaire à la BSA en termes de spécificité de modification et plusieurs études ont utilisé les deux réactifs. Une étude a révélé que le BSTFA était supérieur au BSA en termes de stabilité du produit et de rendement du dérivé. Une autre étude a comparé plusieurs donneurs de triméthylsilyle pour le coiffage final de la silice et a observé que le BSTFA était plus réactif que la BSA mais moins réactif que le TMCim. La BSA et la BSTFA ont été utilisées pour préparer des dérivés triméthylsilyliques de pyrimidines et de purines. Le BSTFA est utilisé à des fins analytiques ou comme réactif chimique pour la synthèse de molécules plus complexes. C'est un réactif de silylation utile en GC et GC-MS pour la dérivatisation d'une large gamme de groupes fonctionnels dans des conditions douces. Le BSTFA est un intermédiaire pharmaceutique important, qui peut réduire la polarité des composés contenant des groupes hydroxy et augmenter leur volatilité, rendant les échantillons plus adaptés à l'analyse GC. En tant que réactif de silanylation neutre et doux, il présente non seulement une réactivité élevée, une bonne sélectivité, mais présente également les avantages d'un rendement de réaction élevé et d'un post-traitement simple. Il est également utilisé comme inhibiteur de DAT et inhibiteur de SLC6A2. Il est couramment utilisé pour dériver des acides carboxyliques, des phénols, des stéroïdes, des amines, des alcools, des alcaloïdes et des amides.